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ALGORITHMS AND COMPUTATIONAL MATHEMATICS RESEARCH UNIT
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Projects

SiMarkers


Luglio 2022 – Luglio 2024

Nell’ambito del progetto SiMarker, l’obiettivo è lo sviluppo di un modulo di IA in grado di predire il decorso clinico dei pazienti affetti da glioma, fornendo al medico uno strumento per la scelta del percorso terapeutico più indicato. Questo permetterà una caratterizzazione più precisa del fenotipo tumorale sfruttando a pieno tutte le informazioni contenute nei dati estratti. Per le finalità del progetto verranno coinvolti ricercatori interni a SI e collaboratori, specializzati negli ambiti di ricerca chiave: le metodologie di AI applicate all’analisi di diverse omiche.
Referente progetto: Romina D’Aurizio




PRIN2022- CM4TGCG –  “Computational Methods for Third Generation Cancer Genomics”


2024 – 2026

Il progetto di focalizza sulle tecnologie di sequenziamento di terza generazione (TGS) basate su sensori a nanopori e si propone di sviluppare metodi computazionali per sfruttare le long-read per identificare le alterazioni genomiche ed epigenomiche nei tumori. Tali metodi ci permetteranno di caratterizzare i profili genomici ed epigenomici alla diagnosi e alla recidiva in pazienti con Melanoma. L’obiettivo è dimostrare che i dati di sequenziamento nanopore ad alta copertura possono essere utilizzati per studiare l’evoluzione del tumore con un singolo esperimento, riducendo i costi sperimentali e i tempi di esecuzione. Due unità: UniFi (Pi) – IIT-CNR
Referente progetto: Romina D’Aurizio



CRCSCREEN (ColoReCtal cancer SCREENing): focus on omics biomarkers on liquid biopsy and urine


1 gennaio 2020 – 31 dicembre 2023

The Tuscany Region is very active in the colorectal screening (CRC) program based on the fecal immunochemical test (FIT). But, this screening is not flawless, its sensitivity is low and the specificity is suboptimal. The aim of the project is the development of a panel of new “omics” biomarkers that can improve the early diagnosis of advanced CRC and AD.
Referente progetto: Romina D’Aurizio



MOBILITANDO Pisa: new home-school and home-work paths


01 giugno 2018 – 30 aprile 2022

The project aims to respond to the reorganization needs with a view to permanent and integrated global sustainable mobility and the goal to make urban mobility again a resource for the city and not a problem with consequent limitations and restrictions. The National Research Council (CNR) is responsible for the development of the innovative application, the experimental phase of the project, the analysis of mobility data to calibrate planned and future interventions, including training and dissemination.
Referente progetto: Maria Elena Renda



Progetti terminati



Mobiwallet: Mobility and Transport digital Wallet (EU FP7)

2014/16



The role of tandem repeats in neurodegenerative diseases: a genomic and proteomic approach (PRIN 2015)

2017/2019
Partners: CNR-IIT (Pisa), Università dell’Insubria, Università del Piemonte Orientale.



Eligibility of miRNAs modified by docetaxel in prostate cancer cells to plasma biomarkers in patients responsive or no more responsive to docetaxel

2016-2018
Funding: ITT Istituto Toscano Tumori
Partners: CNR-IFC (Pisa), CNR-IIT (Pisa), AUSL n. 8 Arezzo